Studijní program kombinuje studium a aktivní práci v oblasti matematiky s řešením problémů, které jsou motivovány potřebami praxe, využívají nové možnosti výpočetní techniky a reagují na pokrok v oblasti aplikované matematiky. Absolventi se uplatní zejména ve výzkumných odděleních softwarových a průmyslových firem, ve vědeckých institucích, případně na vysokých školách.
Doktorský studijní program je součástí Doktorské školy, která spojuje Matematicko-fyzikální fakultu Univerzity Karlovy, Matematický ústav Akademie věd ČR, Fakultu elektrotechniky a informatiky VŠB – Technické univerzity Ostrava a IT4Innovations národní superpočítačové centrum.