Cílem doktorského studijního programu je připravovat vysoce kvalifikované odborníky, schopné dále rozvíjet svůj obor nalézáním nových originálních řešení, metod a postupů, jakož i schopné aplikovat nejnáročnější známé metody. Studenti mají možnost se profilovat v mnoha různých oborech jako jsou informatika, počítačové vidění, strojové učení, umělá inteligence, HPC počítání, výpočetní chemie, nano robotika a mnoho dalších. Absolventi snadno získají práci ve výzkumu a vývoji high-tech firem či nastoupí akademickou kariéru na vysokých školách u nás či v zahraničí.