Magisterský studijní program Aplikovaná elektronika je zaměřen na samostatnou tvůrčí činnost v dílčích oblastech elektrotechniky, mezi které patří průmyslová elektronika, výkonová elektronika a elektrické pohony. Studium je proto zaměřeno na prohloubení teoretického základu elektrotechnických oborů a dále na detailnější seznámení s moderními poznatky v užším zaměření, na které navazuje téma diplomové práce. Magisterské studium umožňuje studentům navázat na příbuzné bakalářské studijní obory, které jsou nabízeny na Fakultě elektrotechniky a informatiky VŠB-TUO a na jiných vysokých školách.