Hlavním cílem předmětu Systémová analýza je seznámit studenty se základními systémovémi pojmy, systémy, subsystémy a prvky systému, kompozicí a dekompozicí. Dále budou studenti seznámeni s teorií grafů, budou umět popsat systém pomocí grafu, provádět operace na grafech, řešit dopravní problémy na grafech, projektovat činnosti s využitím metody kritické cesty a PERT, optimalizovat technologický postup a jeho řízení. Dalšími tématy předmětu jsou: teorie pravděpodobnosti, teorie náhodných procesů, systémy hromadné obsluhy, teorie her, nekooperativní hry v čistých a smíšených strategiích, distribuční úlohy jako aplikace lineárního programování, teorie zásob, úlohy optimálních skladů.