Přeskočit na hlavní obsah
Přeskočit hlavičku

Moderní nástroje pro zpracování a analýzu biomedicínských dat

Typ studia bakalářské
Jazyk výuky čeština
Kód 450-2108/01
Zkratka MNpZaABD
Název předmětu česky Moderní nástroje pro zpracování a analýzu biomedicínských dat
Název předmětu anglicky Modern tools for biomedical data processing and analysis
Kreditů 3
Garantující katedra Katedra kybernetiky a biomedicínského inženýrství
Garant předmětu Ing. Jan Kubíček, Ph.D.

Osnova předmětu

Přednášky:
Softwarové prostředí pro práci MATLABu se SIMULINKem a Pythonu: Aplikační oblast použití. Základní pojmy.
Pracovní prostředí MATLABu a Pythonu, konstanty, proměnné, vektory a matice, datové soubory, m-soubory.
Základní matematické operátory - aritmetické, rotační a logické. Výpočty se skaláry a poli. Zobrazení a tisk výsledků operací.
Programování, Skripty a Funkce v MATLABu a Pythonu. Příkazy IF, ELSEIF, FOR, LOOPS, WHILE.
Grafické zobrazení výsledků zpracování úloh. 2D grafika.
Trojrozměrné grafické zobrazení výsledků zpracování úloh. Souhrn příkazů.
Graficko uživatelské rozhraní GUI. Tvorba, návrh uživatelských rozhraní pomocí textových funkcí uicontrol, uimenu a v GUI editoru.
Numerické řešení lineárních rovnic.Práce s polynomy,Numerická integrace, derivace. Interpolace, regrese.
Statistická zpracování výsledků měření. Jednoduché analýzy - minimum, maximum, medián, suma, aj. Odchylky. Histogramy. Náhodná čísla a jejich funkce. Hustoty rozložení.
Grafické programování v prostředí SIMULINKu.
Použití softwarů MATLAB a Python pro zpracování medinských signálů.
Použití softwarů MATLAB a Python pro zpracování medinských obrazů.
Úvod do umělé inteligence v MATLABu a Pythonu.

Počítačové laboratoře:
Softwarové prostředí pro práci MATLABu se SIMULINKem a Pythonu: Aplikační oblast použití. Základní pojmy.
Pracovní prostředí MATLABu a Pythonu, konstanty, proměnné, vektory a matice, datové soubory, m-soubory.
Základní matematické operátory - aritmetické, rotační a logické. Výpočty se skaláry a poli. Zobrazení a tisk výsledků operací.
Programování, Skripty a Funkce v MATLABu a Pythonu. Příkazy IF, ELSEIF, FOR, LOOPS, WHILE.
Grafické zobrazení výsledků zpracování úloh. 2D grafika.
Trojrozměrné grafické zobrazení výsledků zpracování úloh. Souhrn příkazů.
Graficko uživatelské rozhraní GUI. Tvorba, návrh uživatelských rozhraní pomocí textových funkcí uicontrol, uimenu a v GUI editoru.
Numerické řešení lineárních rovnic.Práce s polynomy,Numerická integrace, derivace. Interpolace, regrese.
Statistická zpracování výsledků měření. Jednoduché analýzy - minimum, maximum, medián, suma, aj. Odchylky. Histogramy. Náhodná čísla a jejich funkce. Hustoty rozložení.
Grafické programování v prostředí SIMULINKu.
Použití softwarů MATLAB a Python pro zpracování medinských signálů – vybrané aplikace.
Použití softwarů MATLAB a Python pro zpracování medinských obrazů – vybrané aplikace.
Úvod do umělé inteligence v MATLABu a Pythonu – vybrané aplikace na strojové učení.

E-learning

Materiály jsou dostupné v https://lms.vsb.cz/

Povinná literatura

M. Penhaker. Práce v prostředí MATLAB. Ostrava: Vysoká škola báňská - Technická univerzita, 2007

Kozák, Š., Kajan,S.: Matlab - Simulink I, 1. vyd.. - Bratislava Slovenská technická univerzita, 1999. - 125 s., il. ISBN 80-227-1213-2

Kozák, Š.: Matlab - Simulink II, 1. vyd.. - Bratislava : Slovenská technická univerzita, 1999. - 141 s, il. ISBN 80-227-1235-3

Dušek, F.: Matlab a Simulink, úvod do používání, - Vyd. 1.. - Pardubice, Univerzita Pardubice, 2000. - 146 s., il. ISBN 80-7194-273-1

BEAZLEY, David M. Python: referenční programátorská příručka. Přeložil Petr ZAVADIL. Praha: Neocortex, 2002. ISBN 80-86330-05-2

Doporučená literatura

Zaplatílek, K., Doňar, B.: MATLAB : tvorba uživatelských aplikací ,. - 1. vyd.. - Praha, BEN, 2004. - 215 s., il. ISBN 80-7300-133-0

Sedláček, M., Šmíd, R.: MATLAB v měření, - 1. vyd.. - Praha, Vydavatelství ČVUT, 2004 dotisk. - 204 s., il. ISBN 80-01-02851-8 Gavalec M. a kol.

Gavalec M.: Pravdepodobnosť a matematická štatistika v počítačovom prostredí MATLABu ,... [et al.]. - 2. opr. Vyd, Košice : Elfa [Košice], 2002. - 152 s., il. ISBN 80-89066-05-4

Stejskal, V., Okrouhlík,M.: Kmitání s Matlabem , - Vyd. 1.. - Praha, Vydavatelství ČVUT, 2002. - 376 s., il. ISBN 80-01-02435-0

Noskievič, P.: Modelování a identifikace systémů, - Ostrava, Montanex, 1999. - iv, ii, 276 s., il. ISBN 80-7225-030-2