Přednášky:
1) Úvod do molekulární biologie
2) Podobnost sekvencí
3) Suffixové stromy
4) Vyhledávání v databázích
5) Alignment
6) Algoritmus Needleman-Wunsch
7) Dynamické programování
8) Predikce sekundární struktury RNA
9) Predikce genů
10) Evoluční stromy
11) Sekvenování DNA
12) Populační genetika
Cvičení na počítačové učebně:
1) Procvičení základních pojmů ze stringologie
2) Procvičení algoritmů pro výpočet podobnosti sekvencí
3) Algoritmy pro konstrukci suffixové stromy
4) Informace o základních biologických databázích, ukázka použití
5) Procvičení algoritmů pro výpočet Alignmentu
6) Algoritmus Needleman-Wunsch
7) Příklady využití dynamického programování
8) Algoritmy pro predikci sekundární struktury RNA
9) Procvičení pojmů potřebných pro predikci genů.
10) Procvičení algoritmů pro tvorbu evolučních stromů
11) Procvičení pojmů potřebných pro sekvenování DNA
12) Procvičení pojmů potřebných pro populační genetiku
1) Úvod do molekulární biologie
2) Podobnost sekvencí
3) Suffixové stromy
4) Vyhledávání v databázích
5) Alignment
6) Algoritmus Needleman-Wunsch
7) Dynamické programování
8) Predikce sekundární struktury RNA
9) Predikce genů
10) Evoluční stromy
11) Sekvenování DNA
12) Populační genetika
Cvičení na počítačové učebně:
1) Procvičení základních pojmů ze stringologie
2) Procvičení algoritmů pro výpočet podobnosti sekvencí
3) Algoritmy pro konstrukci suffixové stromy
4) Informace o základních biologických databázích, ukázka použití
5) Procvičení algoritmů pro výpočet Alignmentu
6) Algoritmus Needleman-Wunsch
7) Příklady využití dynamického programování
8) Algoritmy pro predikci sekundární struktury RNA
9) Procvičení pojmů potřebných pro predikci genů.
10) Procvičení algoritmů pro tvorbu evolučních stromů
11) Procvičení pojmů potřebných pro sekvenování DNA
12) Procvičení pojmů potřebných pro populační genetiku