1. Úvod do speciální mikrobiologie, taxonomie mikroorganismů, systematické přístupy
2. Sinice (Cyanobacteria) - základy morfologie a fyziologie sinic, významné taxony, přehled toxinů a jejich účinků, další využití sinic
3. Řasy (Algae) - základní morfologie a fyziologie řas, rozdělení řas podle typů stélek a obsahu barviv
4. Řasy (Algae) - přehled systému, základní skupiny řas, přehled zástupců, možnosti jejich využití v moderních biotechnologiích
5. Prvoci (Protozoa) - základní morfologie a fyziologie prvoků, přehled systematických skupin
6. Prvoci (Protoza) - charakteristické znaky významných skupin prvoků, jejich rozdělení, přehled patogenních zástupců
7. Roztoči (Acari) - základní morfologie a fyziologie roztočů
8. Roztoči (Acari) - charakteristické znaky systematicky významných skupin, jejich rozdělení, přehled zástupců
9. Významní zástupci živočišných mikroorganismů – ploštěnci (Plathelminthes), hlísti (Nemathelminthes), vířníci (Rotifera), želvušky (Tardigrada), korýši (Crustacea), význam vodních a půdních mikroorganismů v ekosystému
10. Mikromycety (Fungi) - charakteristika mikromycet a jejich postavení v systému hub, základní morfologie a fyziologie
11. Mikromycety (Fungi) - systematicky významné skupiny mikromycet, zástupci, toxické druhy, biotechnologické využití
12. Kvasinky a kvasinkové organismy - morfologie a fyziologie, základní metabolické dráhy, technologicky významní zástupci
13. Mikroorganismy v environmentálních biotechnologiích - využití mikroorganismů k detekci mutagenů v životním prostředí, biodegradační mikroorganismy a jejich význam
14. Mikroorganismy v průmyslových biotechnologiích - přehled mikroorganismů využívaných při bioúpravách uhlí a dalších nerostných surovin, další významné druhy mikroorganismů v průmyslové praxi
2. Sinice (Cyanobacteria) - základy morfologie a fyziologie sinic, významné taxony, přehled toxinů a jejich účinků, další využití sinic
3. Řasy (Algae) - základní morfologie a fyziologie řas, rozdělení řas podle typů stélek a obsahu barviv
4. Řasy (Algae) - přehled systému, základní skupiny řas, přehled zástupců, možnosti jejich využití v moderních biotechnologiích
5. Prvoci (Protozoa) - základní morfologie a fyziologie prvoků, přehled systematických skupin
6. Prvoci (Protoza) - charakteristické znaky významných skupin prvoků, jejich rozdělení, přehled patogenních zástupců
7. Roztoči (Acari) - základní morfologie a fyziologie roztočů
8. Roztoči (Acari) - charakteristické znaky systematicky významných skupin, jejich rozdělení, přehled zástupců
9. Významní zástupci živočišných mikroorganismů – ploštěnci (Plathelminthes), hlísti (Nemathelminthes), vířníci (Rotifera), želvušky (Tardigrada), korýši (Crustacea), význam vodních a půdních mikroorganismů v ekosystému
10. Mikromycety (Fungi) - charakteristika mikromycet a jejich postavení v systému hub, základní morfologie a fyziologie
11. Mikromycety (Fungi) - systematicky významné skupiny mikromycet, zástupci, toxické druhy, biotechnologické využití
12. Kvasinky a kvasinkové organismy - morfologie a fyziologie, základní metabolické dráhy, technologicky významní zástupci
13. Mikroorganismy v environmentálních biotechnologiích - využití mikroorganismů k detekci mutagenů v životním prostředí, biodegradační mikroorganismy a jejich význam
14. Mikroorganismy v průmyslových biotechnologiích - přehled mikroorganismů využívaných při bioúpravách uhlí a dalších nerostných surovin, další významné druhy mikroorganismů v průmyslové praxi