Přeskočit na hlavní obsah
Přeskočit hlavičku

Molekulární modelování pomocí silových polí

Typ studia doktorské
Jazyk výuky angličtina
Kód 635-0962/02
Zkratka MMSP
Název předmětu česky Molekulární modelování pomocí silových polí
Název předmětu anglicky Molecular modeling using force fields
Kreditů 10
Garantující katedra Katedra tepelné techniky
Garant předmětu doc. Ing. Jonáš Tokarský, Ph.D.

Osnova předmětu

Identifikace problému řešitelného molekulárním modelováním s využitím silových polí.
Identifikace, interpretace a využití výsledků instrumentálních analytických metod pro potřeby přípravy iniciálního modelu.
Základní chemické výpočty pro potřeby přípravy iniciálního modelu.
Výběr modelovací strategie pro řešený problém.
Interpretace výsledků molekulárního modelování a komparace s experimentálními daty.
Molekulární modelování interkalátů (praktické cvičení).
Molekulární modelování mísitelnosti vybraných látek (praktické cvičení).
Molekulární modelování sorpce malých molekul (praktické cvičení).
Molekulární modelování nanočástic na anorganickém substrátu (praktické cvičení).
Simulace rentgenové difrakce anorganických a organických struktur (praktické cvičení).
Simulace infračervených spekter vybraných látek (praktické cvičení).

Povinná literatura

SMIT, B. and D. FRENKEL. Understanding molecular simulation: from algorithms to applications. 2. vyd. San Diego: Academic Press, 2002. ISBN 978-0122673511 
HINCHLIFFE, A. Molecular modelling for beginners. 2. vyd. Hoboken, NJ: Wiley, 2008. ISBN 978-0470513149 
COMBA, P. a T. W. HAMBLEY. Molecular modeling of inorganic compounds. 2. vyd. Weinheim: Wiley-VCH, 2001. ISBN 3-527-297778-2

Doporučená literatura

POSPÍŠIL, M. a M. VETEŠKA. Výpočetní postupy v molekulární dynamice. Materials Structure. 2012, roč. 19, č. 2, s. 71-74