Ukončeno v akademickém roce 2021/2022

Úvod do molekulových simulací

Typ studia	navazující magisterské
Jazyk výuky	čeština
Kód	9600-1012/01
Zkratka	UMS
Název předmětu česky	Úvod do molekulových simulací
Název předmětu anglicky	Introduction to Molecular Simulations
Kreditů	4
Garantující katedra	IT4Innovations
Garant předmětu	prof. RNDr. René Kalus, Ph.D.

Osnova předmětu

1. Repetitorium klasické statistické termodynamiky, statistické soubory.
2. Repetitorium klasické mechaniky, pohybové rovnice.
3. Molekulové a mezimolekulové interakce, silová pole.
4. Metody molekulární dynamiky pro NVE soubor.
5. Metody molekulární dynamiky pro další statistické soubory.
6. Numerické řešiče pohybových rovnic.
7. Markovovy řetězce, přechodové matice, Metropolisův algoritmus.
8. Generátory pseudonáhodných čísel.
9. Metody Monte Carlo pro NVT soubor.
10. Metody Monte Carlo pro další statistické soubory.
11. Metody urychlení konvergence (parallel tempering).
12. Repetitorium kvantové mechaniky a kvantové statistické termodynamiky.
13. Kvantové metody Monte Carlo.

Povinná literatura

1.Nezbeda, I., Kolafa J., Kotrla M. Úvod do počítačových simulací. Metody Monte Carlo a molekulární dynamiky, Karolinum, Praha 2003, ISBN 80-246-0649-6.
2.Allen, M.P., Tildesley, D.J. Computer Simulations of Liquids. Oxford Science Publications, Oxford 1989, .

Doporučená literatura

1.Hinchliffe, A., Molecular modelling for beginners, Second edition, John Wiley & Sons Ltd, Chichester 2008, .

zpět na vyhledávání