Mikroorganismy v posttěžebních ekosystémech, vliv prostředí na strukturu mikrobiální populace, abiotické a biotické podmínky sukcese mikrobioty in situ
Metody studia mikrobiálních populací v industriálním prostředí, základní faktory ovlivňující stabilitu mikrobiální populace, metody analýzy kontaktní mikrobioty
Mikrobiomy v antropogenně kontaminovaných půdách, PGPR-mikroorganismy a jejich význam v revitalizaci půd
Aktivita mikroorganismů v průmyslových odpadních vodách, mikroorganismy v důlních vodách, problematika patogenů při zpětném využití vod
Vliv industriálního prostředí na genotyp mikroorganismů, determinanty kovové rezistence, evoluce a adaptace MO vůči toxickým kovům a polokovům
Mikroorganismy jako indikátory stavu prostředí, význam mikroorganismů v testech ekotoxicity
Mikrobiální bioprospekce, význam hledání a testování nových kmenů, metody identifikace mikroorganismů, základní databáze pro vědeckou práci, orientace v databázích
Taxonomie a systematika mikroorganismů (se zaměřením na téma disertační práce)
Fyziologie a metabolismus mikroorganismů, adaptační mechanismy na úrovni metabolických procesů, extremofilní mikroorganismy
Mikrobiální biotechnologie – mikroorganismy jako zdroj nových enzymů a bioaktivních metabolitů, jejich význam v průmyslových biotechnologiích
Metody studia mikrobiálních populací v industriálním prostředí, základní faktory ovlivňující stabilitu mikrobiální populace, metody analýzy kontaktní mikrobioty
Mikrobiomy v antropogenně kontaminovaných půdách, PGPR-mikroorganismy a jejich význam v revitalizaci půd
Aktivita mikroorganismů v průmyslových odpadních vodách, mikroorganismy v důlních vodách, problematika patogenů při zpětném využití vod
Vliv industriálního prostředí na genotyp mikroorganismů, determinanty kovové rezistence, evoluce a adaptace MO vůči toxickým kovům a polokovům
Mikroorganismy jako indikátory stavu prostředí, význam mikroorganismů v testech ekotoxicity
Mikrobiální bioprospekce, význam hledání a testování nových kmenů, metody identifikace mikroorganismů, základní databáze pro vědeckou práci, orientace v databázích
Taxonomie a systematika mikroorganismů (se zaměřením na téma disertační práce)
Fyziologie a metabolismus mikroorganismů, adaptační mechanismy na úrovni metabolických procesů, extremofilní mikroorganismy
Mikrobiální biotechnologie – mikroorganismy jako zdroj nových enzymů a bioaktivních metabolitů, jejich význam v průmyslových biotechnologiích