Přednášky:
1) Seznámení s principy fungování organismů na úrovni DNA
2) Podobnost sekvencí
3) Datové struktury
4) Alignment
5) Sestavení genomu
6) Algoritmy pro vyhledávání v biologických databázích
7) Predikce genů
8) Principy technologií v analýze biologických dat
9) Detekce variant
10) Exprese genů
11) Statistické metody pro analýzu exprese genů
12) Fylogenetická analýza dat
Cvičení na počítačové učebně:
1) Procvičení základních pojmů pro práci s DNA
2) Procvičení algoritmů pro výpočet podobnosti sekvencí
3) Algoritmy pro konstrukci suffixových stromů
4) Procvičení algoritmů pro globální a lokální alignment
5) Procvičení algoritmů pro sestavení genomu
6) Přístup do databází BLAST a procvičení algoritmů pro vyhledávání v biologických databázích
7) Procvičení pojmů potřebných pro predikci genů.
8) Seznámení se s různými reprezentacemi biologických dat
9) Procvičení pojmů potřebných pro detekci variant
10) Procvičení pojmů potřebných pro expresi genů
11) Procvičení statistické analýzy dat z exprese genů
12) Procvičení algoritmů pro tvorbu evolučních stromů
1) Seznámení s principy fungování organismů na úrovni DNA
2) Podobnost sekvencí
3) Datové struktury
4) Alignment
5) Sestavení genomu
6) Algoritmy pro vyhledávání v biologických databázích
7) Predikce genů
8) Principy technologií v analýze biologických dat
9) Detekce variant
10) Exprese genů
11) Statistické metody pro analýzu exprese genů
12) Fylogenetická analýza dat
Cvičení na počítačové učebně:
1) Procvičení základních pojmů pro práci s DNA
2) Procvičení algoritmů pro výpočet podobnosti sekvencí
3) Algoritmy pro konstrukci suffixových stromů
4) Procvičení algoritmů pro globální a lokální alignment
5) Procvičení algoritmů pro sestavení genomu
6) Přístup do databází BLAST a procvičení algoritmů pro vyhledávání v biologických databázích
7) Procvičení pojmů potřebných pro predikci genů.
8) Seznámení se s různými reprezentacemi biologických dat
9) Procvičení pojmů potřebných pro detekci variant
10) Procvičení pojmů potřebných pro expresi genů
11) Procvičení statistické analýzy dat z exprese genů
12) Procvičení algoritmů pro tvorbu evolučních stromů