Modelování proudění podzemních vod je jedním ze základních prostředků analýzy a predikce přírodních procesů a dějů. Modely slouží jako podklady v řadě navazujících procesů, jako jsou analýzy rizika, stanovení ochranných pásem vodních zdrojů, projektování skládek a úložišť škodlivých odpadů. Kvalitně zpracované modely vedou k podstatnému zvýšení efektivity navazujících prací a ke snížení celkových finančních nákladů při realizaci hydrogeologických prací. V oblasti modelování proudění podzemních vod se aktuálně věda zaměřuje na problematiku vývoj a testování vlastního simulačního nástroje pro simulaci proudění a transportu rozpuštěných látek v rozpukaném porézním prostředí, simulace hydrogeologických experimentů, realizace modelů vybraných oblastí a interpretace geologických dat a jejich transformace.