Přeskočit na hlavní obsah
Přeskočit hlavičku

Multikriteriální analýzy CANOCO

Typ studia navazující magisterské
Jazyk výuky čeština
Kód 546-0115/01
Zkratka CAN
Název předmětu česky Multikriteriální analýzy CANOCO
Název předmětu anglicky Multicriterial analyses CANOCO
Kreditů 2
Garantující katedra Katedra environmentálního inženýrství
Garant předmětu Ing. Hana Švehláková, Ph.D.

Osnova předmětu

1. Práce s daty. Typy používaných dat. Sběr dat. Primární data. Přepis a kontrola dat. EDA. CDA. Transformace dat
2. Ekologická data a jejich využití. Ekologická podobnost. Indexy biodiverzity. Ellenbergovy indikační hodnoty. Funkční vlastnosti druhů.
3. Základní terminologie mnohorozměrných statistických metod.
4. Regrese. Lineární modely. Regresní křivky.
5. Ordinační analýza. Modely odpovědí druhů na gradient prostředí. Základní ordinační techniky a metody.
6. Nepřímá ordinace. PCA (analýza hlavních komponent). CA (korespondenční analýza). DCA (detrendovaná korespondenční analýza)
7. Přímá ordinace. RDA (redundanční analýza). CCA (kanonická korespondenční ananlýza)
8. Model nulové hypotézy. Monte Carlo permutační test. Testovací statistiky.
9. Praktické příklady použití ordinací. Případové studie.
10. Klasifikační analýza. Nehierarchická klasifikace.
11. Klasifikační analýza. Hierarchická klasifikace (cluster analysis). Divizivní klasifikace.
12. Praktické případy použití klasifikací. Případová studie.
13. Design experimentů - manipulační vs. přírodní experimenty.

Povinná literatura

HEBÁK, P., HUSTOPECKÝ, J., PECÁKOVÁ, I., PRŮŠA, M., ŘEZANKOVÁ, H., SVOBODOVÁ, A. a P. VLACH. Vícerozměrné statistické metody 3. Praha: Informatorium, 2005. ISBN 80-7333-039-3
HERBEN, Tomáš a Zuzana MÜNZBERGOVÁ. Zpracování geobotanických dat v příkladech. Část I: Data o druhovém složení, 2001; http://www.natur.cuni.cz/~botanika/
HENDL, Jan. Přehled statistických metod zpracování dat. Praha: Portál, 2012. ISBN 978-80-262-0200-4
ŠMILAUER, Petr a Jan LEPŠ. Multivariate analysis of Ecological Data using CANOCO 5.Cambridge University Press, 2014. ISBN 978-11396-2706-1 
LEGENDRE, Pierre a Louis LEGENDRE. Numerical Ecology, vol. 24. Elsevier, 2012. ISBN 978-0-444-53868-0 

Doporučená literatura

LEPŠ, Jan a Petr ŠMILAUER. Metody mnohorozměrné statistiky v analýze ekologických dat. Studijní materiál ke kursu. České Budějovice: Biologická fakulta Jihočeské university, 1994
JANOUŠOVÁ, Eva, Jiří HOLČÍK, Danka HARUŠTIAKOVÁ, Simona LITTNEROVÁ a Jiří JARKOVSKÝ. Vícerozměrné statistické metody v biologii. Brno: CERM, 2012. ISBN 978-80-7204-791-8 
MARHOLD, Karol a Jan SUDA. Statistické zpracování mnohorozměrných dat v taxonomii (Fenologické metody). Praha: Karolinum, 2002. ISBN 80-246-0438-8 
ZVÁRA, Karel. Biostatistika. Praha: Karolinum, 2008. ISBN 80-7184-773-9