Přeskočit na hlavní obsah
Přeskočit hlavičku

Základy zpracování environmentálních dat

Typ studia bakalářské
Jazyk výuky čeština
Kód 546-0169/01
Zkratka ZZED
Název předmětu česky Základy zpracování environmentálních dat
Název předmětu anglicky Basics of Environmental Data Processing
Kreditů 3
Garantující katedra Katedra environmentálního inženýrství
Garant předmětu doc. Mgr. Oldřich Motyka, Ph.D.

Osnova předmětu

1. Příprava vzorkovacího plánu, uchovávání a ukládání biologických dat.
2. Typy biologických dat – kvantitativní a kvalitativní data, popis, charakteristiky polohy a variability, vizualizace, identifikace odlehlých hodnot.
3. Úvod do testování hypotéz – nulová a alternativní hypotéza, chyby I. a II. druhu, statistický test a jeho síla, p – hodnota.
4. Statistické hodnocení biodiverzity, typy diverzity, indexy biodiverzity a jejich výpočet.
5. Úvod do práce v programu R a v rozhraní R Studio. Vytváření projektů, vkládání dat, grafické výstupy.
6. Jednovýběrové a dvouvýběrové testy – parametrické a neparametrické metody. Analýza kategoriálních dat – chí-kvadrát a Fisherův test.
7. Analýza rozptylu (ANOVA)- hodnocení rozptylu biologických a ekologických dat, hodnocení normality, Kruskal-Wallisův test – neparametrická alternativa analýzy rozptylu.
8. Korelační analýza – Pearsonův a Spearmanův korelační koeficient, míry podobnosti v ekologii (koeficienty podobnosti, koeficienty korelace, kovariance).
9. Regresní analýza – lineární regrese, předpoklady lineárního modelu, odhad parametrů regresního modelu, koeficient determinace, základní statistické testy.
10. Regresní analýza – polynomiální regrese, základní statistické testy, analýza reziduí regresních analýz.
11. Úvod do vícenásobné lineární regrese – typy interakcí proměnných, multikolinearita, problém chybějících dat, aplikace na biologická a ekologická data.
12. Mnohorozměrná analýza dat – základní principy, předpoklady a úprava dat před analýzou.
13. Explorativní analýzy, analýza hlavních komponent (PCA), mnohonásobná korespondenční analýza (MCA), analýza smíšených dat (FAMD), shluková analýza.

E-learning

Submission of assigned protocols.
Semester work.

Povinná literatura

HENDL, Jan. Přehled statistických metod zpracování dat. Praha: Portál, 2012. ISBN 978-80-262-0200-4
ZVÁRA K. Biostatistika. Praha: Nakladatelství Karolinum, 2006
LEPŠ, J. a P. ŠMILAUER. Biostatistika. České Budějovice: Episteme, 2016. ISBN 978-80-7394-587-9 
SOKAL, R. a F. J. ROHLF. Biometry: The Principles and Practice of Statistics in Biological Research. New York: W.H. Freeman and Company, 2012. ISBN 978-0-7167-8604-7 
ZAR, J. H. Biostatistical Analysis. Uttar Pradesh, India: Pearson India Education Services, 2014. ISBN 978-9-3325-3667-8 

Doporučená literatura

ZVÁRA, K. Základy statistiky v prostředí R. Praha: Karolinum, 2013. 259 s. ISBN 978-80-246-2245-3
PEKÁR, S. a M. BRABEC. Moderní analýza biologických dat. Praha: Scientia, 2009. ISBN 978-80-8696-044-9
CRAWLEY, M. J. Statistics: An introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005. xiii, 327 s. ISBN 0470022973 
PETRIE, A. a P. WATSON. Statistics for Veterinary and Animal Science. Wiley-Blackwell, 2006