Přeskočit na hlavní obsah
Přeskočit hlavičku

Molekulární modelování pomocí silových polí

Anotace

Cílem předmětu je prohloubit schopnosti studenta rozpoznat problém řešitelný metodami molekulárního modelování. V rámci předmětu budou probírány zejména otázky vstupních experimentálních dat, výběru vhodné modelovací strategie a interpretace výsledků získaných molekulárním modelování. Vzhledem k použité metodě molekulárních simulací pomocí silových polí není tento předmět zaměřen na elektronové vlastnosti materiálů, ale na jejich strukturu a chování za daných podmínek. Praktická cvičení, která jsou hlavním obsahem tohoto předmětu, jsou zaměřena např. na povrchovou modifikaci, interkalaci, sorpci, mísitelnost, ale rovněž na simulaci rentgenové difrakce či infračervených spekter. V rámci předmětu budou studentům také poskytnuty ukázky úspěšných aplikací metod molekulárního modelování v materiálovém výzkumu.

Povinná literatura

SMIT, B. and D. FRENKEL. Understanding molecular simulation: from algorithms to applications. 2. vyd. San Diego: Academic Press, 2002. ISBN 978-0122673511 
HINCHLIFFE, A. Molecular modelling for beginners. 2. vyd. Hoboken, NJ: Wiley, 2008. ISBN 978-0470513149 
COMBA, P. a T. W. HAMBLEY. Molecular modeling of inorganic compounds. 2. vyd. Weinheim: Wiley-VCH, 2001. ISBN 3-527-297778-2

Doporučená literatura

POSPÍŠIL, M. a M. VETEŠKA. Výpočetní postupy v molekulární dynamice. Materials Structure. 2012, roč. 19, č. 2, s. 71-74


Jazyk výuky čeština, angličtina
Kód 9360-0239
Zkratka MMSP
Název předmětu česky Molekulární modelování pomocí silových polí
Název předmětu anglicky Molecular modeling using force fields
Garantující katedra Centrum nanotechnologií
Garant předmětu doc. Ing. Jonáš Tokarský, Ph.D.