Biomarkery a výpočetní proteomika
| Typ studia | doktorské |
|---|---|
| Jazyk výuky | angličtina |
| Kód | 460-6029/02 |
| Zkratka | VP |
| Název předmětu česky | Biomarkery a výpočetní proteomika |
| Název předmětu anglicky | Biomarkers and Computational proteomics |
| Kreditů | 10 |
| Garantující katedra | Katedra informatiky |
| Garant předmětu | prof. MUDr. Vít Procházka, Ph.D. |
Subject syllabus
• biomarkery a jejich využití v medicíně
• validace a verifikace biomarkerů
• využití proteomiky a analýz proteomu v klinických aplikacích
• identifikace a charakterizace proteinů (metody detekce, de novo sekvenování, testování významnosti, posttranslační modifikace, skládání proteinů a degradace, proteinové komplexy)
• kvalitativní a kvantitativní analýzy proteinů, metody detekce proteinů
• predikce struktury proteinů, modelování struktury proteinů
• klinicky významné proteiny ve zdraví a nemoci
• vybrané kapitoly z klinické hemato-onkologie a imunologie, neinvazivní biomarkery
• proteomické databáze
• analýza a interpretace dat vytvořených v proteomických experimentech
• validace a verifikace biomarkerů
• využití proteomiky a analýz proteomu v klinických aplikacích
• identifikace a charakterizace proteinů (metody detekce, de novo sekvenování, testování významnosti, posttranslační modifikace, skládání proteinů a degradace, proteinové komplexy)
• kvalitativní a kvantitativní analýzy proteinů, metody detekce proteinů
• predikce struktury proteinů, modelování struktury proteinů
• klinicky významné proteiny ve zdraví a nemoci
• vybrané kapitoly z klinické hemato-onkologie a imunologie, neinvazivní biomarkery
• proteomické databáze
• analýza a interpretace dat vytvořených v proteomických experimentech
E-learning
Konzultace prostřednictvím MS Teams.
Literature
• Barh D, Carpi A, Verma M, Gunduz M. Cancer Biomarkers: Minimal and Noninvasive Early Diagnosis and Prognosis. 1st Edition (2017) CRC Press
• Series Editors: Cohen IR, Lajtha A, Lambris JD, Pailetti R, Rezaei N. Advances in Experimental Medicine and Biology. Springer Nature International Publishing AG. ISSN: 0065-2598
• Twyman, R. M. Principles of Proteomics, 2nd Edition (2013), Garland Science, New York
• Lovaric, J. Introducing Proteomics (2011), Wiley-Blackwell, Hoboken, New Jersey
• Series Editors: Cohen IR, Lajtha A, Lambris JD, Pailetti R, Rezaei N. Advances in Experimental Medicine and Biology. Springer Nature International Publishing AG. ISSN: 0065-2598
• Twyman, R. M. Principles of Proteomics, 2nd Edition (2013), Garland Science, New York
• Lovaric, J. Introducing Proteomics (2011), Wiley-Blackwell, Hoboken, New Jersey
Advised literature
• Goh W.W., Wong, L. Computational proteomics: designing a comprehensive analytical strategy. Drug Discov Today. 2014.