Biomarkery a výpočetní proteomika

Typ studia	doktorské
Jazyk výuky	angličtina
Kód	460-6029/02
Zkratka	VP
Název předmětu česky	Biomarkery a výpočetní proteomika
Název předmětu anglicky	Biomarkers and Computational proteomics
Kreditů	10
Garantující katedra	Katedra informatiky
Garant předmětu	prof. MUDr. Vít Procházka, Ph.D.

Subject syllabus

• biomarkery a jejich využití v medicíně
• validace a verifikace biomarkerů
• využití proteomiky a analýz proteomu v klinických aplikacích
• identifikace a charakterizace proteinů (metody detekce, de novo sekvenování, testování významnosti, posttranslační modifikace, skládání proteinů a degradace, proteinové komplexy)
• kvalitativní a kvantitativní analýzy proteinů, metody detekce proteinů
• predikce struktury proteinů, modelování struktury proteinů
• klinicky významné proteiny ve zdraví a nemoci
• vybrané kapitoly z klinické hemato-onkologie a imunologie, neinvazivní biomarkery
• proteomické databáze
• analýza a interpretace dat vytvořených v proteomických experimentech

Literature

• Barh D, Carpi A, Verma M, Gunduz M. Cancer Biomarkers: Minimal and Noninvasive Early Diagnosis and Prognosis. 1st Edition (2017) CRC Press
• Series Editors: Cohen IR, Lajtha A, Lambris JD, Pailetti R, Rezaei N. Advances in Experimental Medicine and Biology. Springer Nature International Publishing AG.
• Twyman, R. M. Principles of Proteomics, 2nd Edition (2013), Garland Science, New York
• Lovaric, J. Introducing Proteomics (2011), Wiley-Blackwell, Hoboken, New Jersey

Advised literature

• Goh W.W., Wong, L. Computational proteomics: designing a comprehensive analytical strategy. Drug Discov Today. 2014.

back to search page