Přeskočit na hlavní obsah
Přeskočit hlavičku

Biomarkery a výpočetní proteomika

Anotace

Předmět zaměřen na biomarkery, jejich validace a verifikace a jejich využití v biomedicíně. Dále bude student seznámen s metodami a nástroji používanými ve výpočetní biologii a proteomice (alignment sekvencí a struktur, predikce struktury proteinů, skládání proteinů, interakce protein-protein, proteinový design a modelování). Budou diskutovány kvalitativní a kvantitativní metody detekce proteinů, jejich význam a využití v biomedicíně a diskutován dopad změn na vybraná onemocnění a komplikace. Cílem je pomoci studentům rychle zvládnout problematiku proteomiky, jejich klinického využití a interpretací proteomických dat a být schopni používat výpočetní nástroje k řešení problémů v jejich vlastním výzkumu. Budou diskutovány příklady a praktické ukázky analýz relevantních datových souborů a praktické využití proteomiky a analýz proteomu v biomedicíně.

Povinná literatura

• Barh D, Carpi A, Verma M, Gunduz M. Cancer Biomarkers: Minimal and Noninvasive Early Diagnosis and Prognosis. 1st Edition (2017) CRC Press
• Series Editors: Cohen IR, Lajtha A, Lambris JD, Pailetti R, Rezaei N. Advances in Experimental Medicine and Biology. Springer Nature International Publishing AG. ISSN: 0065-2598 
• Twyman, R. M. Principles of Proteomics, 2nd Edition (2013), Garland Science, New York
• Lovaric, J. Introducing Proteomics (2011), Wiley-Blackwell, Hoboken, New Jersey

Doporučená literatura

• Goh W.W., Wong, L. Computational proteomics: designing a comprehensive analytical strategy. Drug Discov Today. 2014.


Jazyk výuky čeština, angličtina
Kód 460-6029
Zkratka VP
Název předmětu česky Biomarkery a výpočetní proteomika
Název předmětu anglicky Biomarkers and Computational proteomics
Garantující katedra Katedra informatiky
Garant předmětu prof. MUDr. Vít Procházka, Ph.D.